בימים הקרובים ייפתח מקטע במסילה המזרחית למרות שהפרויקט טרם הושלם
על המסילה המזרחית אחראיות החברות הממשלתיות רכבת ישראל ונתיבי ישראל. רכבת ישראל אחראית על המקטע מראש העין עד לוד ונתיבי ישראל אחראית על המקטע שמחדרה עד ראש העין. עלות הקמת הפרויקט היא 9 מיליארד שקל, אך הביצוע לא נעשה בהתאם לתוכניות המאושרות. מדו"חות בקרה פנימיים עולה, כפי שכותבת יפעת ראובן בדה מרקר, שבחלק מהקו יש להחליף את הקירות האקוסטיים שנבנו סמוך ליישובים כדי להפחית את מפגעי הרעש מהרכבות החולפות, או לבצע בהם תיקון, אם זה אפשרי, שכן מדובר בפגם הנדסי. ההחלפה של הקירות עלולה לעלות עשרות מיליוני שקלים. בנוסף מדווחים על פגיעה בעצים לשימור עד כדי מוות של עצים, השלכת פסולת עפר שלא כחוק ברציפי התחנות, בשטחים חקלאיים ובאתרי העבודה ושפיכה של בטון על הקרקע ושפיכה "עבריינית ופיראטית" של פסולת.
מקור בפרויקט מציין שמשרד התחבורה אינו מתייחס כראוי אל הליקויים בעבודה של נתיבי ישראל ורכבת ישראל. בעבודות יש כשלים רבים והחברות עושות בשטח מה שהן רוצות. במשרד התחבורה וברכבת ישראל אומרים שקבלני הביצוע מטעם רכבת ישראל מפנים את הפסולת מאתרי העבודה לאתרי הטמנה או מיון לפי חוק. הפסולת האמורה מושלכת ע"י קבלנים עבריינים שאינם קשורים לרכבת והרכבת פועלת ללא הרף לפינוי הפסולת האמורה, לתיחום שטחי העבודה ע"י התקנת מכשולים ושערים ואל מול משטרת ישראל. במערכת התכנון אומרים גורמים בכירים שנראות הפרויקטים ואופן ההקמה הם נושאים חשובים אם רוצים להיות מדינה מתוקנת. זה מתחיל מהקמה שלא לפי תוכניות מאושרות ועד לליקויים הנדסיים בהמשך.
ב־26.6 צפוי להיפתח המקטע הצפוני של המסילה המזרחית בין תחנות חדרה מזרח, שומרון טייבה, טירה כוכב יאיר וראש העין צפון, למרות שלא הושלמו בו עבודות חישמול. הקו תוכנן להיות חשמלי מיומו הראשון לכל אורכו. אורכו של מקטע זה הוא 41 ק"מ מתוך 65 ק"מ של הקו כולו, אך כאמור, ייסעו בו בינתיים רכבות דיזל למרות העמדה המקצועית הקובעת שיש לסיים קודם את עבודות התשתית במקטע הדרומי ואת עבודות החישמול לאורך כל הקו. כך שעבודות החישמול בקו יבוצעו רק אחרי השעה 21:00 ובימים שישי ושבת, שבהם הקו לא יהיה פעיל. התדירות של הרכבות במקטע הצפוני מחדרה עד ראש העין, דרך טירה וטייבה תהיה 2 רכבות בשעה. המקטע הדרומי בקו שבין תחנות ראש העין צפון דרך שוהם תעופה, אלעד ועד לוד, אמור להיפתח בסוף 2026 או בתחילת 2027.
